為配合國家推動生物科技醫療產業及研發人才培育的產業需要，民國94年8月成立基礎醫學研究所，招收碩士班研究生，並於民國105年8月獲教育部核准更名為生物醫學暨藥學研究所。因應此教育目標，本所積極延攬國內外生醫藥學研究專長之優秀學者，以有限的資源創造優質的研究及教學環境。在研究及教學方面涵蓋神經科學、細胞生物學、分子生物學、腫瘤生物學、遺傳基因體學等多項。

本所未來的研究發展方向，將整合現有基礎、臨床和跨領域醫學研究的資源，從細胞、分子及基因等層面探索老化相關疾病之研究，進而延伸至預防及延緩老化藥物之研發。除此之外，將積極推動生醫藥學研究與臨床醫學及產業界的結合，以拓展本所生醫藥學研究的應用性及能見度，提供學生了解整體醫療生物科技產業各面向並與實務結合，為將來選擇就業的廣度，提供最具深度的背景知識。

歷任所長：
    王啟仲教授 (113.08~迄今)
　林盈宏教授 (110.08~113.07)
　蔡怡汝教授 (104.08~110.07)
　王素珍教授 (098.08~104.07)
　陳炳輝教授 (095.08~098.07)
　王長君教授 (094.08~095.07)